📰 Introduction

En 2026, les holdings occupent une place stratégique dans l’organisation des groupes d’entreprises.
Souvent utilisées pour détenir des participations, optimiser la fiscalité et centraliser la gestion, elles soulèvent de nombreuses questions en matière de TVA.

Peut-on récupérer la TVA sur les frais de la holding ?
Une holding doit-elle facturer la TVA à ses filiales ?
Et comment la facturation électronique modifie-t-elle les obligations déclaratives ?

Dans ce guide pratique EKONTA, nous faisons le point sur toutes les règles TVA applicables aux holdings en 2026, leurs droits, obligations et bonnes pratiques.

🧭 1. Rappel : qu’est-ce qu’une holding ?

Une holding (ou société mère) est une société qui détient des parts ou actions d’autres sociétés appelées filiales.
Elle peut être :

  • Pure, lorsqu’elle se limite à la détention de participations ;

  • Animatrice, lorsqu’elle participe activement à la gestion du groupe (stratégie, finances, marketing, RH…).

💡 Cette distinction est essentielle car elle conditionne le droit à déduction de la TVA.

⚖️ 2. Holding et TVA : une question d’activité économique

Le principe fondamental est simple :

Seules les sociétés exerçant une activité économique soumise à TVA peuvent récupérer la TVA sur leurs dépenses.

Ainsi :

  • Une holding pure (simple détention de titres) n’a pas d’activité économique → elle n’est pas assujettie à la TVA.

  • Une holding animatrice, en revanche, rend souvent des prestations de services facturées à ses filiales (gestion, conseil, assistance, etc.) → elle est assujettie à la TVA et peut déduire la TVA sur ses charges.

💡 En 2026, les contrôles fiscaux automatisés via la facturation électronique renforcent la traçabilité de ces prestations.

💼 3. TVA déductible : dans quels cas la holding peut récupérer la TVA ?

✅ Cas 1 : Holding animatrice (activité économique réelle)

Une holding peut récupérer la TVA sur :

  • Les frais généraux liés à la gestion du groupe (audit, comptabilité, juridiques, informatique…).

  • Les honoraires de conseil pour la direction, la stratégie ou la finance.

  • Les frais d’acquisition de titres (sous conditions).

👉 Condition essentielle : la holding doit facturer des prestations soumises à TVA à ses filiales, prouvant une activité économique effective.

🚫 Cas 2 : Holding pure (simple détention)

Dans ce cas, la société ne récupère pas la TVA sur ses dépenses, car elle n’a pas de chiffre d’affaires taxable.
Les frais engagés (comptabilité, notaire, avocat, etc.) restent à sa charge TTC.

🧩 4. La notion d’“imputation partielle” de la TVA

Certaines holdings exercent à la fois une activité économique (services facturés) et non économique (détention passive).
Elles doivent alors procéder à une répartition de la TVA déductible, selon un coefficient de déduction (ou prorata de TVA).

Exemple :
Si 60 % du chiffre d’affaires de la holding provient de prestations soumises à TVA, elle ne pourra déduire que 60 % de la TVA sur ses dépenses mixtes.

💡 Une bonne comptabilité analytique est donc indispensable pour calculer ce prorata avec précision.

🧾 5. TVA et facturation électronique en 2026

La réforme de la facture électronique, généralisée entre 2026 et 2028, impacte directement les holdings.

Principaux changements :

  • Les holdings assujetties à TVA devront émettre et recevoir leurs factures via une plateforme agréée (PDP ou PPF).

  • Les flux intragroupes (services entre holding et filiales) devront être déclarés via le e-reporting.

  • Les données de TVA seront automatiquement transmises à l’administration.

💡 EKONTA accompagne ses clients dans la mise en conformité à la e-facturation et la centralisation des données de TVA.

🌍 6. TVA et opérations intra-groupe

Les opérations entre sociétés d’un même groupe doivent être traitées avec soin :

🔹 Prestations internes

Si la holding facture des prestations de services à ses filiales, elle doit :

  • Appliquer la TVA au taux en vigueur (20 % en général),

  • Fournir une facture conforme (mention TVA, e-facture dès 2026),

  • Déclarer la TVA collectée et déduire la TVA payée.

🔹 Groupe TVA (régime optionnel)

Depuis 2023, il est possible de constituer un groupe TVA : plusieurs sociétés liées peuvent être traitées comme un seul assujetti à la TVA.
Avantages :

  • Suppression de la TVA sur les transactions internes.

  • Simplification des déclarations.

  • Optimisation de la trésorerie.

👉 En 2026, ce régime est de plus en plus adopté par les groupes familiaux et holdings animatrices.

⚠️ 7. Les erreurs fréquentes à éviter

  • ❌ Considérer à tort une holding pure comme assujettie à la TVA.

  • ❌ Oublier d’appliquer un prorata de déduction pour les activités mixtes.

  • ❌ Négliger la facturation interne des prestations de management.

  • ❌ Confondre le régime de groupe TVA avec le régime fiscal d’intégration.

  • ❌ Omettre les obligations de facture électronique pour les flux internes.

💡 Un suivi régulier par un cabinet comme EKONTA permet d’éviter les redressements et d’optimiser la récupération de TVA.

🧮 8. Exemple concret

Une holding animatrice facture à ses filiales :

  • 60 000 € de prestations de conseil (assujetties à TVA 20 %),

  • Et supporte 12 000 € de TVA sur ses propres dépenses.

➡️ Elle collecte 12 000 € de TVA sur ses ventes.
➡️ Elle déduit 12 000 € de TVA sur ses achats.
➡️ Résultat : TVA neutre pour le groupe, tout en assurant la conformité des flux.

🧭 9. EKONTA, partenaire de vos holdings

Chez EKONTA, nous accompagnons les holdings et groupes d’entreprises dans :

  • La structuration juridique et fiscale de leurs activités,

  • La mise en place du régime de TVA le plus avantageux,

  • L’implémentation de la facture électronique,

  • Et la gestion centralisée de la comptabilité et de la trésorerie.

Notre approche : optimiser votre organisation tout en garantissant la conformité légale.

🏁 Conclusion

En 2026, la TVA pour les holdings n’est plus une simple formalité : c’est un outil stratégique de pilotage et d’optimisation.
Bien maîtrisée, elle permet d’éviter les redressements, d’améliorer la gestion de groupe et de profiter des nouveaux outils numériques de facturation.

👉 Faites-vous accompagner par EKONTA, votre partenaire expert en fiscalité et comptabilité des structures de groupe.